细菌耐药，正成为人类健康的“隐形杀手”。世界卫生组织预测，到2050年，耐药性细菌每年将夺走超过1000万人的生命，超过癌症跃居全球死亡首因。在抗生素日益失效的严峻形势下，噬菌体疗法通过利用专门“猎杀”细菌的天然病毒来精准歼灭耐药菌，被视为对抗超级细菌的革命性武器，正重新进入临床视野。

然而，噬菌体疗法的临床转化长期面临一道难以跨越的门槛：如何在最短时间内，为患者体内的耐药菌找到最有效的“猎手”噬菌体？目前公认的检测金标准是噬菌斑实验。但是，该方法需要11至21小时才能给出答案，且结果仅为定性判断，无法告诉医生“哪株噬菌体效力更强”“需要用多少剂量”。每一分钟的等待，对于感染超级耐药菌的重症患者而言，都可能意味着难以挽回的器官损伤。

近期，深圳市第三人民医院/传染与感染性疾病国家临床医学研究中心卢洪洲教授团队与中国科学院青岛生物能源与过程研究所徐健研究员团队携手，在《mLife》（中国微生物学会旗舰期刊）发表了题为 “Rapid and quantitative phage susceptibility test by ramanome”的重要研究成果。该研究创新开发了基于拉曼组（Ramanome）的噬菌体敏感性测试平台（RPST），为噬菌体疗法检测提供了新的技术思路。

RPST的主要发现之一在于观察到一个生物学现象：噬菌体感染细菌后，在细菌裂解之前，宿主细胞的蛋白质、核酸、脂质等大分子组成已发生系统性重塑，且这一重塑信号可被拉曼光谱精准捕获。团队从中提炼出四个具有一定保守性的拉曼生物标志物，并通过随机森林算法将其整合为复合感染指数（CII），可以作为连续、定量的群体水平感染指标。此外，整个检测主要是将患者分离耐药菌与候选噬菌体共孵育40分钟，经离心洗涤后采集拉曼光谱，计算机自动输出CII，单样品全程耗时约1小时，相比传统噬菌斑实验方法速度提升明显。更重要的是，CII在单一工作流中同步实现三项核心诊断：①判定噬菌体能否感染目标菌株；②定量排序多株候选噬菌体的感染效力；③通过时间-剂量动态曲线确定“最小有效感染复数（MOI）”，该指数可为临床给药方案提供参考依据。

本研究在覆盖大肠杆菌、铜绿假单胞菌、沙门菌、肺炎克雷伯菌的25个噬菌体-宿主对中完成验证，RPST与金标准噬菌斑实验的符合率高达96.0%（24/25），显示了较好的跨菌种适用性。

RPST的应用，为《国务院令818号》技术轨监管框架下噬菌体疗法的备案临床研究提供了提供了一种有潜力的标准化参考工具。团队下一步将在大湾区多中心耐药菌感染临床研究中尝试应用该平台，并探索与人工智能噬菌体适配预测模型的深度整合，推动该方法向临床转化，为深圳乃至全国超级耐药菌感染患者的治疗提供新的方向。

该论文的共同第一作者为青岛能源所韩霄和深圳国家感染中心万晓芙，共同通讯作者为青岛能源所徐健、深圳三院卢洪洲和济南大学黄加栋。研究得到了国家自然科学基金（32030003、32571695）和中国科学院青年科学家基础研究项目（YSBR-111）等多项基金的资助。

论文信息： Han X, Wan X, Zhou Y et al. Rapid and quantitative phage susceptibility test by ramanome. mLife, 2026. DOI: 10.1002/mlf2.70089