中国中西医结合学会传染病专业委员会于2006年2月成立，挂靠于广东省深圳市第三人民医院，是中国中西医结合学会所辖51个专业委员会之一，是目前深圳市唯一一个全国性医学专业委员会。

    2012年9月13-15日，第四次全国中西医结合传染病学术会议由市三院主持在上海斯格威铂尔曼大酒店召开，大会共收到论文132篇，到会代表250多人。中国中西医结合学会会长、中国科学院院士陈凯先教授出席了会议，并作了“转化医学与中医药现代化”的专题报告。

    会议进行了一系列的学术讲座，交流的论文包括：病毒性肝炎63篇，艾滋病与肺结核12篇，手足口病等29篇，理论探讨7篇，列题21篇，展示了近两年我国中西医结合传染病研究的最新动态。会议期间还举行了中国中西医结合学会第二届传染病专业委员会第三次委员会议，交流了一年来的工作进展，初步确定下一步工作计划：申请创办《中国中西医结合传染病杂志》，创办《中国中西医结合学会传染病专业委员会网站》；积极参与、进一步协助卫生部和国家中医药管理局，做好“国家‘十二五’传染病防治大科技专项”的实施；积极参与和组织常见传染病中西医结合诊疗指南的制定，以手足口病、重型肝炎等作为启动项目，并争取卫生管理部门的支持，配合总会写好近几年的“专科进展报告”。；在前面总结、系统梳理前人经验的基础上，采用大样本临床流行病学调研方法，完成《手足口病：中医药防治》、《传染病辨证体系研究》等书；按时完成总会布置的各项任务和专业委员会的常规工作，争取逐渐提高会议的学术质量和会议形式。；请委员们积极努力进一步组建各省市专业委员会，目前已有北京、天津、山东等成立了中西医结合传染病专业委员会。