质谱流式细胞技术利用质谱原理对单细胞进行多参数检测的流式技术，与传统流式细胞技术相比，质谱流式使用金属元素作为抗体标签，利用ICP质谱实现了单细胞多参数的检测。由于细胞本身不含这些作为标签的金属元素，所以没有传统流式的“自发荧光”，信号背景极低。因金属元素信号之间几乎没有交叉，可一次检测四十多个蛋白标志物，实现对单细胞的深度分析。目前该平台主要应用于血液、免疫、干细胞以及肿瘤等诸多研究领域。肝病研究所于2018年装机Helios，组建了质谱流式分析平台，用于绘制健康人体器官免疫图谱，研究疾病（特别是感染性疾病）状态下的免疫变化，揭示病原体与机体免疫系统的相互作用和发病机理。