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Cell | 鉴定新冠病毒诱发的病理学相关细胞和分子特征

稿件来源:深圳市第三人民医院 发布时间:2021-03-15 16:21:00

  2020年5月12日,国家感染性疾病临床医学研究中心(南方科技大学第二附属医院/深圳市第三人民医院)张政课题组与以色列魏兹曼研究所Ido Amit团队、法国巴斯德研究所Benno Schwikowski团队等合作在Cell杂志在线发表题为“Host-viral infection maps reveal signatures of severe COVID-19 patients”的研究论文。该研究开发了针对单细胞转录组的病毒序列分析方法Viral-Track,并基于该方法揭示了新冠肺炎重症患者病毒-宿主反应,鉴定了病毒诱发的病理学相关细胞和分子特征。

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  过去虽然有一些分析方法可以跟踪高通量测序数据中的病毒转录本,但是用于临床样本数据时往往效果欠佳。近些年兴起的单细胞转录组测序技术由于其技术特点,适合于同时跟踪病毒感染与宿主单细胞的转录组表达变化。该项研究开发了针对单细胞转录组测序数据的病毒序列分析方法对于揭示病毒感染细胞的反应以及宿主关键细胞因子极为重要,可以为病毒的致病机制研究以及新的治疗手段提供关键线索。

  来源:https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.006

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